困住敌人是提高通关效率的关键技巧之一。利用秘卷技能如一字连柱或土遁·土流枪能有效限制敌人行动，这些秘卷具备Y轴攻击效果，即使与敌人不在同一水平线也能造成控制。开局优先选择秘卷强化类能力，例如秘卷连发或秘卷魔化，能大幅提升控制频率和伤害。战斗中注意保留秘卷用于首领战，尤其是面对佩恩天道或宇智波带土忍界大战时，及时打断他们的连招至关重要。
独臂流派通过牺牲部分技能换取超高爆发，配合无臂·均衡等能力可快速击破敌人霸体状态。选择李洛克醉拳或杜门这类体术忍者时，优先强化普攻相关能力如岩落之拳，利用其高连击特性压制敌人。若获得恢复之拳能力，还能在攻击时回血，进一步提升生存能力。注意独臂系能力存在陷阱选项，比如独臂·滑稽会导致无法正常攻击，需仔细阅读说明再选择。
奥义流派依赖查克拉管理，通过永恒查克拉结印增强等能力缩短奥义冷却时间。漩涡鸣人系列忍者适合此流派，远程技能可安全消耗敌人血量，奥义释放时机建议在敌人结束霸体或倒地起身时。搭配奥义回血能力可弥补近战风险，同时通灵兽选择蛤蟆龙能减少技能CD，为连续控制创造机会。面对多阶段首领时，保留奥义用于关键阶段，例如宇智波带土召唤外道魔像时。
部分关卡存在燃烧屋顶或毒雾陷阱，引诱敌人进入这些区域能造成持续伤害。扭曲时空关卡中击败黑白双偶可触发隐藏奖励，但同时会提升后续关卡难度，需根据自身流派强度选择是否挑战。通灵兽猿魔的击飞效果可打断敌人技能，而镰鼬的范围攻击适合清理杂兵，为首领战创造有利条件。
幻之试炼二的随机性较强，开局前两关若未拿到核心能力建议重来。每日击败3名首领可领取金币奖励，彻底通关后还能解锁专属称号幻之征服者。多尝试不同流派组合，找到最适合自己的打法才是制胜之道。
